Informatique pour la régulation 2002-03
Cette page donne l'agenda des séminaires de bioinformatique organisés au
LIFL autour des problèmes
de l'expression des gènes et de leur régulation.
C'est une série qui complète les séminaires organisés par Bernard Vandenbunder dans le cadre de
l' IRI.
Les exposés ont lieu le lundi après-midi à 14h, en amphi Turing
au premier étage du bâtiment M3.
- 24 février : La régulation des gènes (Maude Pupin)
Ce séminaire est un petit cours sur la régulation
des gènes. Je vais commencer par décrire la régulation
à travers deux exemples simples. Puis, je vais introduire
la notion de réseaux de régulation grâce auxquels les
cellules intègrent des informations de diverses natures. [transparents (en ppt)]
- 3 mars : Classification supervisée et non-supervisée des séquences
régulatrices sur base de motifs (Jacques van Helden)
[transparents (en pdf)]
- 10 mars : Identification de paramètres en biologie:
utilisation conjointe du calcul formel et de l'arithmétique
d'intervalle (Michel Petitot)
Le modèle utilisé à titre d'exemple vient des travaux de J. Tyson (thèse
de J. W. Zwolak) sur la division cellulaire. Des articles sur ce thème : sur la page de
J. Zwolak et de B. Novak
- 17 mars : Simulation par agents situés en biologie (Sébastien Picault)
[transparents : pdf, ppt]
- 7 avril : Clarisse Dhaenens
- mardi 29 avril-:Du transcriptome aux réseaux de regulation transcriptionnelle (Bernard Vandenbunder)
[transparents : ppt]
- 5 mai : Biologie moléculaire formelle (Vincent Danos, équipe de logique, Paris VII)
Comment on peut voir les réseaux d'interaction protéine/protéine comme des systèmes concurrents
et les compiler dans le pi-calcul.
- 8 juillet, 14h : De retour d'ISMB 2003 (Ralph Blossey et Enrico Carlon , IRI)
DNA melting and its prediction : This talk will discuss recent work on
the computational prediction of the melting behaviour of
double-stranded DNA, as it is relevant for various analytic processes
in biotechnology. In particular, the issue of the correct
parametrization of the loop entropy factors will be given which are
important for DNA of AT-rich genomes of medium chain length.
Si vous souhaitez donner un exposé, il suffit d'envoyer un mail à
Hélène Touzet.
Ecoles et Séminaires sur le sujet