Le cours 2008-2009 porte sur la modélisation en biologie cellulaire.
Il comporte dix séances d'une heure trente. Il a lieu le mardi de 13h30 à 15h00 au bâtiment M3, dans l'amphi Türing. L'évaluation se fait sur la base d'un examen de deux heures et d'un système de contrôle continu.
Dernière version du polycopié : version du 2 novembre 2009.
Quelques feuilles Maple : feuilles Maple.
Sujets 07-08 :: Partie I
Partie II
Éléments de chimie et de biologie cellulaire
Cours 1. Introduction. Notions élémentaires de biologie cellulaire. Réflexions sur la modélisation.
L'introduction par Kell et Knowles du livre de Szallasi, Stelling et Periwal.
Cours 3. Application aux réseaux de gènes. Calcul des lois de conservation.
Méthodes symboliques pour l'étude des systèmes d'équations
Cours 4. Introduction à la théorie classique des équations différentielles. Analyse qualitative en une variable.
Feuille de TD 2.
Cours 5. Systèmes linéaires en plusieurs variables. Stabilité (Nullclines, points fixes, portrait de phase).
Cours 6. Systèmes non linéaires. Points fixes. Nullclines.
Cours 7. Méthodes algorithmiques (chaînes régulières) pour systèmes non linéaires.
Applications à la réduction de modèles
Cours 8. Introduction au paquetage
MABSys. Réduction approchée QSSA.
Cours 9. Réduction exacte.
Cours 10. Introduction à la modélisation stochastique.