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Équipe Bonsai

Algorithms for large-scale sequence analysis

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L'objectif principal de l'équipe BONSAI est de développer des algorithmes et des modèles pour l'analyse des séquences biologiques. Cela comprend les domaines d'application suivants : l'annotation des génomes, l'analyse des données de séquensage à haut débit, la métagénomique, la structure des génes et des génomes, les ARN non-codants, les peptides non ribosomiques. Les méthodes employées viennent de l'algorithmique discréte, empruntant à l'algorithmique du texte, la théorie des graphes, les structures d'index... Ce travail se matérialise par la diffusion de logiciel libres, et la validation sur des données biologiques.

 

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