Journées ARENA
Structures et fonctions des ARN

26, 27 et 28 mars 2007 - Lille



Cette réunion est organisée par l'ACI impbio Arena, avec le soutien du PPF bio-informatique de l'USTL et de l'INRIA Futurs.

Toutes les informations à imprimer avant de partir : c'est ici.

Transparents des exposés

Lundi 26 mars

Régulation par les petits ARN eucaryotes et procaryotes [PPT]
Daniel Gautheret - Institut de Génétique et Microbiologie, Orsay

Génération aléatoire de structures d'ARN
Yann Ponty - CMB, Boston college [PPT]

Comparaisons de séquences à base de graines espacées pour la recherche d'ARN non-codants [PDF]
Mathieu Giraud - SEQUOIA, LIFL Lille

Tutorial sur l'apprentissage en biologie
Christine Froidevaux - LRI, Orsay

Approches pour la recherche de gènes d'ARN non codant: le cas spécifique des ARN H/ACA, le cas général des ARN structurés
Fabrice Leclerc - Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, Nancy

Mardi 27 mars

Recherche de motifs ARN dans un genome, vite et bien [PDF]
Helene Touzet - SEQUOIA, LIFL Lille

Prediction of RNA Secondary Structure with Pseudoknots
Mohammad Ganjtabesh - LIX, école Polytechnique, Palaiseau [PDF]

Gene regulation with RNA switches and knots
Hervé Isambert - RNA dynamics and Biomolecular Systems, Institut Curie

Classification topologique et prediction Monte Carlo des structures d'ARN
Michael Bon - Service de Physique Théorique, CEA, Saclay

RNA parametric algorithms
Peter Clote - CMB, Boston college

Décomposition arborescente, algorithmes et ARN
Stephane Vialette - LRI, Orsay

Interactions ADN/ARN et ARN/ARN dans les biopuces Affymetrix [PDF]
Enrico Carlon - Institut de Recherche Interdisciplinaire et Polytech-Lille

PARADISE : une plateforme d'annotation des données de l'ARN reposant sur une architecture distribuée
Fabrice Jossinet - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg

Mercredi 28 mars

Biais de composition des séquences d'ARN chez les eucaryotes: utilisation pour l'étude de l'organisation du génome humain
Claude Thermes - Génétique Moléculaire, Gif/Yvette

Finding the building blocks of RNA 3-D structure using graph analysis [PPT]
Romain Riviere - Université de Montréal

Prédiction de structures tridimensionnelles (de séquences) d'ARN
Francois Major - Université de Montréal

Informations pratiques

Les journées sont accueillies par le Restaurant Le Meunier (15 rue de Tournai, Lille), qui dispose d'une salle de séminaires. C'est à 50 mètres de la Gare Lille Flandres et à 300 mètres de la Gare Lille Europe. Les déjeuners de midi sont pris sur place.

Pour le logement, les chambres sont réservées à l'hotel Mister Bed (57 rue de Béthune, 03 20 12 96 96) à 10 minutes à pied. S'il pleut ou si vous êtes chargé, vous pouvez prendre le métro: de la Gare Lille Flandres, prendre la ligne 1 direction CHR Calmette et descendre à la station République Beaux-Arts, de la Gare Lille Europe, prendre la ligne 2 pour rejoindre la ligne 1. Le logement est pris en charge par l'ACI. Vous n'avez donc rien à payer.

Il y a une "sortie culturelle", le lundi en fin d'après-midi, avec la visite du Palais des Beaux-Arts, qui a été récemment rénové et qui est très agréable.

Le diner de mardi soir a lieu au Restaurant La Baignoire, à coté de l'hotel. Le diner du lundi soir est libre.

Enfin, si vous etes sur Lille dimanche apres-midi, il y a un concert gratuit de Philippe Katerine à 17h, place de la République (dans le cadre de la journée du chti 2007).

plan de Lille

1 Restaurant Le Meunier (journées de travail), 15 rue de Tournai
2 Hotel Mister Bed, 57 rue de Béthune, en face des cinémas, 03 20 12 96 96
3 Restaurant La Baignoire (mardi soir), 8, place de Béthune
4 Palais des Beaux-Arts, place de la République (lundi après-midi)

Participants

Julien ALLALI - LABRI, BordeauxDLM
Bertrand BECKERT - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg  LM
Nathalie BERTEAUX - Institut de Biologie de Lille
Guillaume BLIN - Institut Gaspard Monge, Marne la Vallée  L
Michael BON - Service de Physique Théorique, CEA, Saclay  LM
Enrico CARLON - Institut de Recherche Interdisciplinaire de Lille et Polytech-Lille
Peter CLOTE - CMB, Boston college DLM
Marie-Josée CROS - BIA INRA, ToulouseDLM
Yves D'AUBENTON-CARAFA - Centre de Génétique Moléculaire, Gif/Yvette   LM
Alain DENISE - LRI, université Paris-Sud, Orsay  LM
Mahassine DJELLOUL - LRI, université Paris-Sud, Orsay  LM
Christine DREVET - Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris-Sud, Orsay  LM
Stefan ENGELEN - Unité INSERM 511, Paris  LM
Isabelle FAGNOT - Institut Gaspard Monge, Marne la Vallée   L
Alessandro FERRANTINI - Institut de Recherche Interdisciplinaire de Lille
Guillaume FERTIN - LINA, université de Nantes
Arnaud FONTAINE - SEQUOIA LIFL, Lille
Christine FROIDEVAUX - LRI, Université Paris-Sud, Orsay  LM
Mohammad GANJTABESH - LIX, école Polytechnique, Palaiseau DLM
Daniel GAUTHERET - Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris-Sud, OrsayDL
Mathieu GIRAUD - SEQUOIA LIFL, Lille
Claire HERRBACH - LRI, Université Paris-Sud, Orsay  LM
David HOT - Institut Pasteur de Lille
Hervé ISAMBERT - RNA dynamics and Biomolecular Systems, Institut Curie
Fabrice JOSSINET - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg  LM
Gregory KUCHEROV - SEQUOIA LIFL, Lille
Fabrice LECLERC - Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, NancyDLM
Yves LEMOINE - Institut Pasteur de Lille
Adeline LEPAUL - SEQUOIA LIFL, Lille
Francois MAJOR - IRIC - DIRO - Université de Montréal    M
Antonin MARCHAIS - Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris-Sud, Orsay
Anthony MATHELIER - INSERM UMRS 511 - Equipe d'Analyse GénomiqueDLM
Annick MOISAN - BIA INRA, ToulouseDLM
Antoine de MONTE - SEQUOIA LIFL, Lille
Pierre NICODEME - LIX, école Polytechnique, Palaiseau
Laurent NOE - SEQUOIA LIFL, Lille
Henri ORLAND - Service de Physique Théorique, CEA, Saclay  LM
Yann PONTY - CMB, Boston college DLM
Elizabeth PRADEL - INSERM 801, Lille
Franck QUESSETTE - PRiSM, Université de VersaillesDLM
Olivier RAOULT - LRI, université Paris-Sud, Orsay  LM
Mireille REGNIER - INRIA, projet ALGO, Rocquencourt  L
Romain RIVIERE - IRIC - DIRO - Université de MontréalDLM
Jean-Pierre ROUSSET - Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris-Sud, Orsay  LM
Cédric SAULE - LRI, université Paris-Sud, OrsayDLM
Florent SEBBANE - INSERM 801, Lille
Manuel SIMOES - Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, NancyDLM
Jean-Marc STEYAERT - LIX, école Polytechnique, Palaiseau
Fariza TAHI - IBISC. CNRS/ Université d'Evry/GenopoleDLM
Michel TERMIER - Institut de Génétique et Microbiologie, Université Paris-Sud, Orsay  LM
Claude THERMES - Centre de Génétique Moléculaire, Gif/Yvette     M
Helene TOUZET - SEQUOIA LIFL, Lille
Sandrine VIAL - PRiSM -IBISC, Université d'EvryDLM
Stéphane VIALETTE - LRI, université Paris-Sud, Orsay  LM
Bérénice WULBRECHT - Institut Pasteur de Lille

Les indiquent les orateurs.
Les trois dernières lettres sont les réservations d'hotel (D dimanche soir, L lundi soir, M mardi soir).

Organisation

Si vous avez des questions, contactez Axelle Magnier (axelle.magnier@inria.fr, 03 62 53 15 53) et Helene Touzet (helene.touzet@lifl.fr, 03 28 77 85 59).