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@phdthesis{kopylova:tel-00919185,
  hal_id = {tel-00919185},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00919185},
  title = {{Algorithmes bio-informatiques pour l'analyse de donn{\'e}es de s{\'e}quen{\c c}age {\`a} haut d{\'e}bit}},
  author = {Kopylova, Evguenia},
  language = {Anglais},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2013},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00919185/PDF/these.pdf}
}
@phdthesis{pupin:tel-00918918,
  hal_id = {tel-00918918},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00918918},
  title = {{Mod{\`e}les bio-informatiques pour les peptides non-ribosomiques et leurs synth{\'e}tases}},
  author = {Pupin, Maude},
  language = {Fran{\c c}ais},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {HDR},
  year = {2013},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00918918/PDF/hdr\_pupin.pdf}
}
@phdthesis{tran:tel-00832663,
  hal_id = {tel-00832663},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832663},
  title = {{Comparaisons de s{\'e}quences biologiques sur architecture massivement multi-c{\oe}urs}},
  author = {Tran, Tuan Tu},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2012},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832663/PDF/phd-tuan-tu-tran.pdf}
}
@phdthesis{saffarian:tel-00832700,
  hal_id = {tel-00832700},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832700},
  title = {{Algorithmes de pr{\'e}diction et de recherche de multi-structures d'ARN}},
  author = {Saffarian, Azadeh},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2011},
  month = nov,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832700/PDF/phd-azadeh-saffarian.pdf}
}
@phdthesis{darracq:tel-00833144,
  hal_id = {tel-00833144},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833144},
  title = {{{\'E}volution des g{\'e}nomes mitochondriaux de plantes : approche de g{\'e}nomique comparative chez Zea mays et Beta vulgaris}},
  author = {Darracq, Aude},
  affiliation = {G{\'e}n{\'e}tique et {\'e}volution des populations v{\'e}g{\'e}tales - GEPV , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe , Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2010},
  month = jul,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833144/PDF/these\_aude\_darracq\_-\_copie.pdf}
}
@phdthesis{girdea:tel-00833311,
  hal_id = {tel-00833311},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833311},
  title = {{De nouvelles m{\'e}thodes pour l'alignement des s{\'e}quences biologiques}},
  author = {G{\^\i}rdea, Marta L.},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2010},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833311/PDF/50376-2010-Girdea.pdf}
}
@phdthesis{caboche:tel-00823447,
  hal_id = {tel-00823447},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00823447},
  title = {{Mise en place d'une plate-forme logicielle pour l'analyse des peptides non-ribosomiaux}},
  author = {Caboche, S{\'e}gol{\`e}ne},
  affiliation = {Laboratoire des Proc{\'e}d{\'e}s Biologiques G{\'e}nie Enzymatique et Microbien - PROBIOGEM , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2009},
  month = sep,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00823447/PDF/these.pdf}
}
@phdthesis{fontaine:tel-00836757,
  hal_id = {tel-00836757},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00836757},
  title = {{Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants}},
  author = {Fontaine, Arnaud},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2009},
  month = mar,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00836757/PDF/These.pdf}
}
@phdthesis{liefooghe:tel-00832725,
  hal_id = {tel-00832725},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832725},
  title = {{Matrices score-position, algorithmes et propri{\'e}t{\'e}s}},
  author = {Liefooghe, Aude},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL , BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2008},
  month = jul,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832725/PDF/document.pdf}
}
@phdthesis{varre:tel-00832685,
  hal_id = {tel-00832685},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832685},
  title = {{Algorithmes pour la comparaison de g{\'e}nomes et la recherche de signaux cis-r{\'e}gulateurs}},
  author = {Varr{\'e}, Jean-St{\'e}phane},
  affiliation = {BONSAI - INRIA Lille - Nord Europe , Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {HDR},
  year = {2008},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832685/PDF/hdr.pdf}
}
@phdthesis{defrance:tel-00124471,
  hal_id = {tel-00124471},
  url = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00124471},
  title = {{Algorithmes pour l'analyse de r{\'e}gions r{\'e}gulatrices dans le g{\'e}nome d'eucaryotes sup{\'e}rieurs}},
  author = {Defrance, Matthieu},
  affiliation = {Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille - LIFL},
  school = {Universit{\'e} Lille 1},
  type = {THESE},
  year = {2006},
  month = dec,
  pdf = {http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00124471/PDF/these.pdf}
}
@phdthesis{perriquet:thesis,
  author = {Olivier Perriquet},
  title = {approche algorithmique pour la pr{\'e}diction de la structure secondaire des ARN},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {2003},
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@phdthesis{FigeacPHD04,
  author = {Martin Figeac},
  title = {Etude de l'ordre des g{\`e}nes : clusters de g{\`e}nes et algorithmique des r{\'e}arrangements},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {2004}
}
@phdthesis{tahi:these,
  author = {JS Varr\'e},
  title = {Concepts et algorithmes pour la comparaison de s\'equences g\'en\'etiques : une approche informationnelle},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {2000},
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@phdthesis{rivals:thesis,
  author = {Eric Rivals},
  title = {Algorithmes de compression et applications {\`a} l'analyse de s{\'e}quences g{\'e}n{\'e}tiques},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {1996},
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@phdthesis{delgrange:thesis,
  author = {Olivier Delgrange},
  title = {Un algorithme rapide pour une compression modulaire optimale - Application a l'analyse de s{\'e}quences g{\'e}n{\'e}tiques},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {1997},
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@misc{touzet:hdr,
  title = {Structures combinatoires pour l'analyse de g{\'e}nomes},
  author = {H{\'e}l{\`e}ne Touzet},
  school = {Universit\'e des Sciences et Technologies de Lille},
  year = {2005},
  pdf = {http://www.lifl.fr/~touzet/Publications/hdrtouzet.pdf}
}

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