Analyse bio-informatique des données NGS

Lille, le 7 décembre 2011



Le PPF Bioinformatique de l'Université Lille 1, l'IFR 142 Médecine Cellulaire et Moléculaire de l'Institut Pasteur de Lille et l'IFR 114 Médecine Prédictive et Recherche Thérapeutique organisent une journée scientifique sur le thème de l'analyse bio-informatique des données produites par les technologies de séquençage à haut débit, dans la lignée de l'édition de 2009. Cette année, les sujets abordés couvriront plus particulièrement l'analyse du transcriptome, avec les données de type RNA-seq, la recherche d'ARN non-codants, la métatranscriptomique.

Les exposés se tiendront dans l'amphithéatre Butiaux, sur le campus de l'Institut Pasteur de Lille (métro ligne 2, station Grand Palais).

Cette journée sera jumelée au workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, qui aura lieu à partir du lendemain au même endroit.


Programme

9h00-9h30 Café d'accueil, inscriptions
 
9H30-9h40 Présentation de la journée (D. Hot)
 
9h40-10h30 Génomique fonctionnelle des biocarburants : comment associer puces à ADN,
séquençage haut débit et analyses grâce au cloud computing?
Stéphane Le Crom, Université Pierre et Marie Curie
 
10h30-11h20 Mise en évidence des XUTs, une nouvelle famille d'ARN non codants chez la levure
Antonin Morillon, Institut Curie, Paris
 
11h20-12h10 Détection d'ARNs non codants par analyse de données RNA-seq
Claude Thermes, Centre de Génétique Moléculaire, Gif-sur-Yvette
 
12h10-13h45     déjeuner
 
13h45-14h35 Small regulatory RNA in cellular differentiation
Pascal Barbry, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire, Nice
 
14h35-15h25 Les défis statistiques posés par l'application de la technique RNA-seq pour l'étude
métatranscriptomique d'un écosystème fromager
Julie Aubert, UMR MIA AgroParisTech/INRA
 
15h25-15h40     pause
 
15h40-16h30 CRAC: A multi-purpose program to analyse large read collections
Eric Rivals, LIRMM, Montpellier
 
16h30-17h30 Présentations locales, discussion

Inscriptions

Les inscriptions sont closes. Les retardataires peuvent envoyer un mail à helene.touzet_AT_lifl.fr.

Comité d'organisation