Le PPF Bioinformatique de l'Université Lille 1, l'IFR 142 Médecine Cellulaire et Moléculaire de l'Institut Pasteur de Lille et l'IFR 114 Médecine Prédictive et Recherche Thérapeutique organisent une journée scientifique sur le thème de l'analyse bio-informatique des données produites par les technologies de séquençage à haut débit, dans la lignée de l'édition de 2009. Cette année, les sujets abordés couvriront plus particulièrement l'analyse du transcriptome, avec les données de type RNA-seq, la recherche d'ARN non-codants, la métatranscriptomique.
Les exposés se tiendront dans l'amphithéatre Butiaux, sur le campus de l'Institut Pasteur de Lille (métro ligne 2, station Grand Palais).
Cette journée sera jumelée au workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, qui aura lieu à partir du lendemain au même endroit.
| 9h00-9h30 | Café d'accueil, inscriptions |
| 9H30-9h40 | Présentation de la journée (D. Hot) |
| 9h40-10h30 | Génomique fonctionnelle des biocarburants : comment associer puces à ADN, |
| séquençage haut débit et analyses grâce au cloud computing? | |
| Stéphane Le Crom, Université Pierre et Marie Curie | |
| 10h30-11h20 | Mise en évidence des XUTs, une nouvelle famille d'ARN non codants chez la levure |
| Antonin Morillon, Institut Curie, Paris | |
| 11h20-12h10 | Détection d'ARNs non codants par analyse de données RNA-seq |
| Claude Thermes, Centre de Génétique Moléculaire, Gif-sur-Yvette | |
| 12h10-13h45 | déjeuner |
| 13h45-14h35 | Small regulatory RNA in cellular differentiation |
| Pascal Barbry, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire, Nice | |
| 14h35-15h25 | Les défis statistiques posés par l'application de la technique RNA-seq pour l'étude |
| métatranscriptomique d'un écosystème fromager | |
| Julie Aubert, UMR MIA AgroParisTech/INRA | |
| 15h25-15h40 | pause |
| 15h40-16h30 | CRAC: A multi-purpose program to analyse large read collections |
| Eric Rivals, LIRMM, Montpellier | |
| 16h30-17h30 | Présentations locales, discussion |
Les inscriptions sont closes. Les retardataires peuvent envoyer un mail à helene.touzet_AT_lifl.fr.