Le laboratoire ProBioGEM (IFR 147) travaille en collaboration avec l’équipe Bonsai du LIFL depuis plusieurs années, sur des approches bioinformatiques d’analyse de peptides actifs (antibiotiques, anticancéreux etc…) produits par des microorganismes. Cette collaboration s’est traduite par la mise en ligne de la banque de données Norine (http://bioinfo.lifl.fr/norine) qui constitue une référence mondiale dans le domaine. Cette base contient actuellement 1122 composés annotés en fonction de critères structuraux (masse, formule chimique, structure), de leurs activités biologiques, des organismes qui les produisent ou encore des publications de références. Afin de faciliter le peuplement de la base, nous souhaitons développer une (des) interfaces utilisateur qui seront associées à des critères de qualité nous permettant d’évaluer la pertinence et la cohérence des données entrées par les curateurs.
Les compétences informatiques requises : Java, HTML, SGBD, PostgreSQL, STRUTS2.
Il n'est pas nécessaire d'avoir des connaissances en chimie ou biologie pour réaliser ce projet.
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