ACI IMPBio AReNa - Groupe de travail pluridisciplinaire sur la structure et la fonction des ARN

Soutenu par l'ACI IMPBio 2004-07


Journées des 18, 19 et 20 avril 2005

Centre culturel Saint-Thomas - Strasbourg
Liste des participants (pdf)

Lundi 18 avril

9:30-10:50 Cours informatique 1 : algorithmes, complexité et ARN
Alain Denise - LRI ORsay
11:10-12:10 Franchissement de STOP, dérapages en tout genre: quand le riboiome ne respecte pas le code (génétique)
Jean-Pierre Rousset - IGM Orsay [ PPT]
14:30-16:20 Cours Biologie 1
Eric Westhof - IBMC Strasbourg
16:50-17:50 Focus sur la structure tertiaire du ribosome
Francois Major - LBIT Montreal
17:50-18:10 S2S: visualiser, manipuler et interconnecter les données de l'ARN de la séquence à la structure
Fabrice Jossinet - IBMC Strasbourg [PDF]
18:10-18:30 Tracé de structures d'ARN
David Auber - LABRI Bordeaux


Mardi 19 avril

9:00-10:20 Cours informatique 2
Christine Gaspin - INRA Toulouse
10:50-11:50 AReNa+Nantes = AReNantes (activités de l'équipe Combi du LINA)
Guillaume Fertin et Jérémie Bourdon - LINA Nantes
11:50-12:10 Influence du contexte en 3'de l'heptamère sur le décalage de phase en -1 chez les eucaryotes
Michael Bekaert - IGM Orsay [PPT]
14:30-15:30 Cours biologie 2 : Régulation transcriptionnelle
Pascale Romby - IBMC Strasbourg [PPT]
15:50-16:50 titre à venir
Henri Orland - CEA Saclay
16:50-17:10 Identification de gènes bactériens exprimant des ARN non traduits en protéine
Brice Felden - LBP Rennes [ PPT]
17:30-18:30 Diversité des régions non traduites des transcrits, nouveaux développements du programme Erpin
Daniel Gautheret - TAGC Marseille [PPT]
18:30-18:50 Recherche bio-informatique de sRNA à boîtes H/ACA dan sles génomes d'Archeae et démonstration de leur rôle expérimentalement
Sébastien Muller - MAEM Nancy
18:50-19:10 Technique de manipulation de graphes d'ARN
Gilles Bailly - IMAG Grenoble [PDF]


Mercredi 20 avril

9:00-10:00 Développement et utilisation d'approches informatiques et théoriques pour l'analyse de liens existant entre défauts d'épissage et maladies génétiques
Fabrice Leclerc - MAEM Nancy [PDF]
10:00-10:20 Sur l'alignement structurel multiple d'ARN non-codants
Stéphane Vialette - LRI Orsay
10:50-11:10 Complexité du calcul de la distance d'édition - à la Lin et al'01
Guillaume Blin - LINA Nantes [PDF]
11:10-11:30 Comparaison de modèles arborescents multi-échelles de structures secondaires d'ARN
Aïda Ouangraoua - LABRI Bordeaux
11:30-11:50 Comparaison de structures d'ARN
Julien Allali - IGM Marne-la-Vallée [PS]
11:50-12:10 Comparaison de structures d'ARN - bis
Claire Herrbach - LRI Orsay
14:00-15:00 Activités de l'équipe BIA autour des ARN
Christine Gaspin - INRA Toulouse
15:00-15:20 Recherche de motifs optimaux sous contrainte
Matthias Zytnicki - INRA Toulouse [PDF]
15:20-15h40 L'approche comparative pour la prédiction de structures secondaires d'ARN
Stefan Engelen - LAMI Evry


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