Bio-informatique

Calendrier prévisionnel

• lundi 16 janvier : les molécules de la cellule (Corinne Abbadie - 3 heures)
• lundi 23 janvier : l'ADN, support du génome (Corinne Abbadie - 3 heures)
• lundi 30 janvier : l'expression du génome (Corinne Abbadie) et Introduction à la bio-informatique et l'alignement (Hélène Touzet)
• lundi 20 février : suite
• lundi 27 février : la cellule (Corinne Abbadie) et exercices de programmation dynamique (Hélène Touzet)
• lundi 6 mars : diversité du monde vivant (Corinne Abbadie) et alignement multiple (Hélène Touzet)
• lundi 13 mars : controle continu
• lundi 20 mars: Structure et organisatio des génomes (Corinne Abbadie) et motifs biologiques (Hélène Touzet)
• lundi 10 avril: modèles de Markov (Hélène Touzet)
• lundi 15 mai : exercices [correction], prédiction de gènes (Hélène Touzet)
• lundi 22 mai : controle continu (Hélène Touzet),
• lundi 29 mai : La transmission des caractères génétiques et leurs modifications (Corinne Abbadie), phylogénie (Hélène Touzet)

Controle continu

• Interrogation bio (correction)

Séances de TP

• TP 1 : comparaison de séquences (groupe 1 le vendredi 10 fevrier et groupe 2 le vendredi 3 mars)
• TP 2 : anémie falciforme (5 mai et 12 mai), correction de la partie 1
• TP 3 : annotation (19 mai et 26 mai)
• TP 4 : phylogénie (2 juin et 9 juin)

• groupe 1 : etudiants de Licence ne suivant pas l'option PAC
• groupe 2 : etudiants de Master + etudiants de Licence suivant l'option PAC

Ailleurs sur le web

• Quelques repères historiques: développement conjoint de l'informatique, la biologie moléculaire et de la bio-informatique
• La programmation dynamique en bio-informatique par David Sankoff
• La fonction du gène (INRA)
• Evolution: des bactéries à l'homme
• Bookshelf: collection de livres de biologie en libre accès