| Fouille de texte pour la biologie |
Le PPF Bioinformatique organise une journée scientifique sur les applications de la fouille de texte à la biologie: extraction d'information en génomique,inférence des interactions géniques,..
La journée se tiendra dans l'amphithéatre du batiment IRI-IRCICA, sur le campus CNRS de la Haute-Borne à Villeneuve d'Ascq. Le site est desservi par le métro, ligne 1, station Quatre Cantons. A partir du métro, vous êtes à 10 min à pied. Prendre la rue Paul Langevin, à droite (un panneau indique la direction du parc Haute-Borne). Après le Club House, couper par le parking à droite. Une fois sur le rond-point, le bâtiment apparaît sur votre droite. L'entrée est de l'autre coté.
| 9h45-10h05: | Café d'accueil | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10h05-10h15: | Présentation de la journée | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10h15-11h10: | Introduction à la fouille de texte en biologie | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Philippe Bessières (Equipe Bibliome, INRA Jouy en Josas) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 11h10-12h05: | Extraction de relations pharmacogénomiques à partir de la littérature | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Adrien Coulet (LORIA, Nancy) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12h05-12h30: | Genomatix Pathway System (GePS) de Genomatix | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Philippe Youkharibache (Genomatix) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12h30-14h15: | Déjeuner (RU Barrois) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14h15-15h10: | Genie: literature-based gene prioritization at multi genomic scale |
| Jean-Fred Fontaine (Max Delbruck Center for Molecular
Medicine, Berlin) [résumé] | | 15h10-15h40: | Automated vocabulary discovery for geo-parsing online epidemic intelligence |
| Mikaela Keller (Université Lille 3 et INRIA Mostrare) [résumé] | | 15h40-15h55 | Pause | | 15h55-16h20: | Presentation de Pathway
Studio | Olivier Brun (Ariadne Genomics) | | 16h20-16h45: | Introduction à IPA: Un outil pour explorer les mécanismes biologiques | Myriam Boutet (Ingenuity) [résumé] | | 16h45-17h00: | Retours d'utilisation
d'Ingenuity et autres logiciels | Marie-Christine Chartier-Harlin (INSERM U837 JPArc,
Lille)
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La participation est gratuite, mais nous vous demandons de vous inscrire pour permettre l'organisation des pauses et du déjeuner.
Merci d'envoyer un mail avec les informations suivantes avant le 9 septembre à guillemette.marot@univ-lille2.fr.
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Mardi 20 septembre 2011 - journee fouille de texte
Nom:
Prenom:
Laboratoire :
Dejeuner: oui/non
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