Analyse bio-informatique des données
de métagénomique

Le PPF Bioinformatique de l'Université Lille 1 et l'IFR Médecine Cellulaire et Moléculaire de l'Institut Pasteur de Lille organisent une journée scientifique sur le thème de la métagénomique et des méthodes d'analyse bio-informatique et biostatistique associées : assemblage des génomes, classification et quantification des espèces, assignation taxonomique, reconstruction phylogénétique... Cette réunion s'inscrit dans la lignée des éditions 2009 et 2011 sur l'analyse des données NGS.

Les exposés se tiendront dans l'amphithéatre Butiaux, sur le campus de l'Institut Pasteur de Lille (métro ligne 2, station Grand Palais).

Programme

• 10h00 : café d'accueil
  
  
• 10h20 : présentation de la journée (David Hot)
  
  
• 10h30-11h30 : Nicolas Pons, INRA Jouy-en-Josas
  The potential of the new science of metagenomics in curing human complex diseases
  
  
• 11h30-12h20 : Guy Perrière, LBBE, Lyon
  Coding DNA Sequences prediction in shorts reads from metagenomic data
  
  
• 12h20-13h45 : déjeuner
  
  
• 13h45-14h35 : Frédéric Mahé, TU Kaiserslautern
  TARA OCEANS, exploring worldwide marine biodiversity
  
  
• 14h35-15h25 : Mihai Pop, University of Maryland
  Towards Holistic Analyses of Metagenomic Data
  
  
• 15h25-15h40 : pause
  
  
• 15h40-16h30: Jean-Jacques Daudin, AgroParisTech
  Bioinformatics and Statistical challenges from the analysis of NGS-Metagenomics experiments
  
  
• 16h30-17h20 : Sara Vieira-Silva, Vlaams Instituut voor Biotechnologie
  Monitoring the human gut microbiome

Inscriptions

La participation est gratuite, mais nous vous demandons de vous inscrire pour permettre l'organisation des pauses et du déjeuner.

Merci d'envoyer un mail à mohcen.benmounah@lifl.fr avec les informations suivantes pour le 7 décembre.

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        19 decembre  2012 - journee Metagenomique 

        Nom:
        Prenom:
        Laboratoire :
        Dejeuner : oui/non
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Comité d'organisation

• David Hot (Institut Pasteur de Lille)
• Marc Lensink (IRI)
• Guillemette Marot (INRIA, Université Lille 2)
• Hélène Touzet (LIFL et INRIA, Université Lille 1)
• Pascal Touzet (GEPV, Université Lille 1)