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| Programme | Soumission | Inscription | Renseignements pratiques |
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GTGC est un groupe de travail fondé en 2005 pour donner un lieu d'échanges à l'ensemble de la recherche francophone en génomique comparative.
La huitième édition aura lieu les 13 et 14 décembre 2012 à Lille.
Pour cette huitième édition, l'organisation des journées se fera autour d'exposés invités et d'exposés sélectionnés sur résumés courts.
Ces journées sont des journées d'échange et nous engageons les doctorants à proposer une présentation de leurs travaux. Nous insistons aussi sur le fait que nous souhaitons des exposés didactiques permettant à chacun de comprendre et d'échanger sur les travaux des autres.
Cette édition est financée par le LIFL, le PPF Bio-informatique de l'Université Lille 1 et le GDR CNRS 3003 Bioinformatique Moléculaire.
| 13h45-14h00 | Café d'accueil |
| 14h00-14h30 | Identification de variations structurales rares au sein de populations clonales de levures |
| Alexandre Gillet, UMR CNRS 7238 Génomique des Microorganismes | |
| 14h30-15h00 | Le recombinosome de S. cerevisiae expliqué par son génome |
| Raphaël Champeimont, UMR CNRS 7238 Génomique des Microorganismes | |
| 15h00-15h30 | Prédiction de partenaires protéiques. Combinaison de simulations de « docking » croisé et d’information évolutive |
| Anne Lopes, Université Paris-Sud 11 | |
| 15h30-16h00 | Pause |
| 16h00-17h00 | Combiner apprentissage automatique et evolution pour l'identification de domaines proteiques |
| (exposé invité) | Alessandra Carbone, Université Pierre et Marie Curie |
| 17h00-17h30 | Tandem Halving Problems by DCJ |
| Antoine Thomas, Université Lille 1 | |
| 17h30-18h00 | Création d'une carte physique comparée des « BAC End Sequences » du tilapia du Nil (Oreochromis niloticus) |
| Lucile Soler, CIRAD Montpellier | |
| 18h00-18h30 | Algorithme paramétré pour le problème Minimum Common String Partition |
| Laurent Bulteaux, Université de Nantes | |
| 09h00-10h00 | Reconstruction du génome ancestral de l'agent de la peste noire |
| (exposé invité) | Cédric Chauve, Simon Fraser University, Canada |
| 10h00-10h30 | Linearization of ancestral multichromosomal genomes |
| Murray Patterson, UMR CNRS 5558 Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive | |
| 10h30-11h00 | Reconstruction phylogénétique basée sur le partage d'adjacences ancestrales entre blocs de synténie |
| Guénola Drillon, UMR CNRS 7238 Génomique des Microorganismes | |
| 11h00-11h30 | Pause |
| 11h30-12h00 | Evolutionary causes of the expansion of “dangerous” gene families in vertebrates genome |
| Sèverine Affeldt, Institut Curie, CNRS UMR168, Paris | |
| 12h00-12h30 | Gene Family Assignment-Free Comparative Genomics |
| Annelyse Thevenin, Bielefeld University, Allemagne | |
| 12h30-14h30 | Pause déjeuner |
| 14h30-15h30 | Evolutionary rearrangements are neutral and occur according to genome structure |
| (exposé invité) | Camille Berthelot, European Bioinformatics Institute, United Kingdom |
| 15h30-16h00 | Metabolic effectors secreted by bacterial pathogens; essential facilitators of plastid endosymbiosis? |
| Steven Ball, Université Lille 1 | |
La date limite de soumission est fixée au lundi 19 novembre 2012.
Pour soumettre, il suffit d'envoyer un courrier électronique à jean-stephane.varre@univ-lille1.fr en joignant un résumé court (entre 1/2 page et 1 page).
La date limite d'inscription est fixée au dimanche 2 décembre 2012.
L'inscription est gratuite mais obligatoire pour l'organisation (occupation de la salle, pauses, déjeuner).
Pour vous inscrire, merci d'envoyer un courrier électronique à jean-stephane.varre@univ-lille1.fr avec les informations suivantes :
Nom: Prénom: Courriel: Fonction: Laboratoire d'appartenance: Adresse: Dejeuner le 14: oui/non
Les journées se dérouleront du jeudi 13 décembre à 14h au vendredi 14 décembre à 16h sur le campus de l'Université Lille 1, à Villeneuve d'Ascq. Le site est desservi par le métro, ligne 1, station Cité Scientique (plan du campus ), compter environ 20 minutes depuis la gare Lille-Flandres.
Les présentations se dérouleront dans l'amphi Turing du LIFL, dans le bâtiment M3. Voir ce plan pour venir.
L'office du Tourisme de Lille propose un moteur de réservation d'hôtels (sélectionner Lille centre). Ci-dessous quelques hôtels situés à Lille. Il faut compter une vingtaine de minutes en métro pour rejoindre le campus à partir du centre-ville. Il existe également un hôtel situé sur le campus même : Ascotel autour de 100 euros la nuit.
Pour toute question, merci de contacter Jean-Stéphane Varré : jean-stephane.varre@univ-lille1.fr.